More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  77.29 
 
 
206 aa  330  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  77.67 
 
 
201 aa  322  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  73.68 
 
 
209 aa  318  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  69.57 
 
 
201 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  69.57 
 
 
201 aa  303  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  70.41 
 
 
200 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  68.63 
 
 
200 aa  292  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  68.63 
 
 
200 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  67.65 
 
 
200 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  53.8 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  50.24 
 
 
208 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  55.74 
 
 
207 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  51.27 
 
 
206 aa  191  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  53.07 
 
 
205 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  53.07 
 
 
205 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  48.74 
 
 
214 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  42.23 
 
 
211 aa  177  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  45.3 
 
 
210 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  43.81 
 
 
198 aa  154  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  45.05 
 
 
197 aa  151  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  37.2 
 
 
204 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 
204 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  36.71 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  39.42 
 
 
294 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  38.17 
 
 
201 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  36.87 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  41.21 
 
 
291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  41.88 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  42.42 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  38.04 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  41.88 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  40.61 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  41.88 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  45.99 
 
 
295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  46.72 
 
 
291 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
291 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  41.25 
 
 
291 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  39.75 
 
 
291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  44.53 
 
 
295 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  41.25 
 
 
291 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  37.63 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  44.53 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  35.48 
 
 
229 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  44.53 
 
 
295 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  37.11 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  45.26 
 
 
293 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  36.93 
 
 
283 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 
304 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  44.9 
 
 
295 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  44.9 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  33.92 
 
 
291 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  42.75 
 
 
286 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  43.48 
 
 
286 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  39.46 
 
 
222 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  33.94 
 
 
284 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  43.48 
 
 
286 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  38.18 
 
 
291 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  45.99 
 
 
295 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.75 
 
 
291 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  43.8 
 
 
293 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  42.66 
 
 
292 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  44.53 
 
 
295 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  33.92 
 
 
291 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  44.53 
 
 
291 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  38.92 
 
 
222 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 
293 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  43.54 
 
 
298 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  42.66 
 
 
439 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  42.66 
 
 
292 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  39.74 
 
 
285 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
286 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  43.48 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  38.37 
 
 
295 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  39.74 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  43.8 
 
 
291 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  42.75 
 
 
285 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 
198 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  36.13 
 
 
292 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 
293 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  43.07 
 
 
288 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 
284 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  33.84 
 
 
298 aa  101  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  42.75 
 
 
286 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  41.61 
 
 
293 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  42.75 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 
274 aa  100  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 
293 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  38.79 
 
 
291 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  37.8 
 
 
289 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  33.65 
 
 
274 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  42.34 
 
 
296 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  42.03 
 
 
285 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  44.2 
 
 
284 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  43.8 
 
 
293 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>