More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05061 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  90 
 
 
200 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  90 
 
 
200 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  88.5 
 
 
200 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  73.13 
 
 
201 aa  304  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  73.63 
 
 
201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  72.08 
 
 
209 aa  299  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  70.41 
 
 
207 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  73.79 
 
 
206 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  69.8 
 
 
201 aa  291  6e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  54.05 
 
 
195 aa  204  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  49.01 
 
 
206 aa  192  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  50.26 
 
 
214 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  45.89 
 
 
207 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  52.51 
 
 
205 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  52.51 
 
 
205 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  45.41 
 
 
211 aa  181  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  47.51 
 
 
208 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  42.57 
 
 
198 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  46.7 
 
 
210 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  44.32 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  38.05 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  37.88 
 
 
204 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  37.13 
 
 
201 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  38.31 
 
 
200 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  37 
 
 
206 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  37.97 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  35.06 
 
 
294 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  43.38 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  40.65 
 
 
286 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
291 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
291 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  42.24 
 
 
291 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  43.48 
 
 
293 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  41.36 
 
 
291 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 
274 aa  107  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
274 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  40.37 
 
 
291 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  39.47 
 
 
286 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  41.61 
 
 
291 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  44 
 
 
295 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.36 
 
 
204 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  35.02 
 
 
291 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  44.53 
 
 
293 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  43.8 
 
 
293 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  43.8 
 
 
293 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  34.56 
 
 
291 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  43.07 
 
 
295 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
283 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  43.33 
 
 
295 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 
291 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  39.86 
 
 
286 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  40.15 
 
 
293 aa  104  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  34.03 
 
 
298 aa  104  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  35.24 
 
 
291 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
292 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.87 
 
 
210 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  42.03 
 
 
286 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  39.13 
 
 
297 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  42.03 
 
 
286 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
439 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  32.03 
 
 
293 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
285 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  34.57 
 
 
292 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  38.46 
 
 
292 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  42.03 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  41.61 
 
 
293 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  34.7 
 
 
291 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  37.82 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  37.77 
 
 
295 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  42.03 
 
 
285 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
295 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
295 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 
290 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 
294 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  33.51 
 
 
292 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  37.34 
 
 
291 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  36.31 
 
 
210 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  40.67 
 
 
295 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
295 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  40.14 
 
 
274 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  43.8 
 
 
293 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  41.3 
 
 
285 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  41.61 
 
 
293 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
295 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 
204 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  40.88 
 
 
293 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.57 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.81 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 
204 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>