More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12651 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
198 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  77.78 
 
 
198 aa  311  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  61.54 
 
 
206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  59.5 
 
 
200 aa  235  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  59.09 
 
 
201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  62.84 
 
 
204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  58.5 
 
 
204 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  48.09 
 
 
222 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  48.9 
 
 
229 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  46.45 
 
 
222 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  42.13 
 
 
214 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  41.76 
 
 
208 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  39.29 
 
 
206 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  40.66 
 
 
207 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  42.08 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  40.66 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  42.22 
 
 
210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  41.36 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  38.69 
 
 
195 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  40.34 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  40.34 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  32.32 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  32.32 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  36.32 
 
 
215 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  35.98 
 
 
213 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  31.91 
 
 
206 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  32.32 
 
 
201 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  37.63 
 
 
213 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  33.66 
 
 
200 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  34.5 
 
 
224 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 
219 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.49 
 
 
207 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  34.44 
 
 
198 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 
218 aa  101  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  33.83 
 
 
212 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  32.67 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.52 
 
 
217 aa  99  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  32.32 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  32.06 
 
 
215 aa  98.2  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  34.1 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  32.95 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  35.51 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  36 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  32.37 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  32.95 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  30.43 
 
 
292 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  32.37 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  32.95 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  32.95 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  30.92 
 
 
292 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  38.61 
 
 
295 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  33.53 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  31.94 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  32.28 
 
 
236 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  34.31 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  32.66 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  34.48 
 
 
239 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  34.39 
 
 
296 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.89 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  34.43 
 
 
274 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  32.99 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  34.86 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 
283 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  37.97 
 
 
295 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  31.19 
 
 
292 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 
292 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.82 
 
 
244 aa  92  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  32.57 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  33.71 
 
 
206 aa  92  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  31.22 
 
 
231 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  34.98 
 
 
212 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 
239 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  32.03 
 
 
293 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  32.95 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  38.81 
 
 
293 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.55 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  35.86 
 
 
292 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 
287 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  33.15 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  40.74 
 
 
298 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  33.52 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  37.41 
 
 
294 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  32.45 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  29.59 
 
 
239 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 
295 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  36.57 
 
 
295 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 
285 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 
279 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  35.17 
 
 
439 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  32.54 
 
 
295 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  29.65 
 
 
223 aa  88.6  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>