More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3055 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  86.83 
 
 		 203 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  86.83 
 
 		 203 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  84.39 
 
 		 220 aa  349  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  81.95 
 
 		 220 aa  341  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  82.91 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  82.91 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  82.91 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  81.91 
 
 		 197 aa  332  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  81.91 
 
 		 197 aa  331  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  79.51 
 
 		 203 aa  330  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  85.16 
 
 		 180 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  66.99 
 
 		 209 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  69.42 
 
 		 208 aa  283  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  70.5 
 
 		 204 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  65.38 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  73.08 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  63 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  63 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  62.44 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  66.84 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  60.68 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  61.86 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  60 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  61.34 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  57.41 
 
 		 215 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  62.57 
 
 		 206 aa  228  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  60.56 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  62 
 
 		 213 aa  227  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  60.21 
 
 		 194 aa  227  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  61 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  60.5 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  59 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  54.42 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  59.2 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  57.5 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  56.4 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  63.68 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.27 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.04 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.51 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  45.99 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.86 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  37.25 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  38.71 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  38.5 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.15 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.53 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.56 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  34.59 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.3 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  35.32 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.3 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.73 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.89 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.83 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.83 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.87 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  38.16 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.99 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.63 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.97 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.63 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  36.82 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.71 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  36.82 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.99 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  34.64 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  36 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  41.29 
 
 		 293 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  35.63 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  38.2 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  33.5 
 
 		 743 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.02 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  36.21 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.63 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.62 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.69 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  37.7 
 
 		 206 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  33.81 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  35.63 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  34 
 
 		 293 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  32.9 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  34.27 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.24 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.79 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.07 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.81 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.14 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.52 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.98 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.12 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4892  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  32.47 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  35.91 
 
 		 283 aa  99  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  33.71 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.61 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>