More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1296 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  80 
 
 
205 aa  320  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  68.81 
 
 
217 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  62.1 
 
 
215 aa  256  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  67.02 
 
 
194 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  66.67 
 
 
206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  63.16 
 
 
208 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  58.33 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  60.68 
 
 
205 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  60 
 
 
203 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  60 
 
 
203 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.21 
 
 
213 aa  235  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  61.31 
 
 
204 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.94 
 
 
219 aa  231  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  61.39 
 
 
199 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  60.4 
 
 
199 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  59.5 
 
 
197 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  55.35 
 
 
213 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  58.5 
 
 
197 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  58.5 
 
 
197 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  58.5 
 
 
197 aa  222  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  64.29 
 
 
181 aa  221  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  57.14 
 
 
212 aa  221  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  58 
 
 
197 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  57.62 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  56.4 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  57.79 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  55.61 
 
 
203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  58.71 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  56.74 
 
 
239 aa  218  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.61 
 
 
217 aa  218  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  57.58 
 
 
220 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  56.42 
 
 
212 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  58.65 
 
 
206 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  54.76 
 
 
224 aa  216  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  63.19 
 
 
180 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.61 
 
 
209 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  56.78 
 
 
220 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  56.78 
 
 
212 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  52.23 
 
 
223 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  50 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  44.56 
 
 
198 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.96 
 
 
215 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.63 
 
 
215 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.63 
 
 
215 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  36.1 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.14 
 
 
222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.85 
 
 
208 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.08 
 
 
210 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.76 
 
 
198 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  36.5 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.92 
 
 
209 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  35.05 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.17 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  38.62 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7137  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.17 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.86 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  33.82 
 
 
209 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.63 
 
 
209 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.29 
 
 
204 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.63 
 
 
213 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.29 
 
 
210 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.85 
 
 
221 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.12 
 
 
203 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  34.69 
 
 
201 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.33 
 
 
221 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.2 
 
 
204 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.2 
 
 
204 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.52 
 
 
221 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5011  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.29 
 
 
201 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565569  normal  0.0682866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  33.17 
 
 
206 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.8 
 
 
210 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.13 
 
 
202 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.46 
 
 
209 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  33.86 
 
 
209 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  38.25 
 
 
283 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  35.36 
 
 
214 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.29 
 
 
205 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.58 
 
 
209 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.58 
 
 
209 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  34.54 
 
 
210 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  35.06 
 
 
211 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.57 
 
 
210 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.35 
 
 
205 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.96 
 
 
211 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.8 
 
 
209 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4892  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  33.7 
 
 
229 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.05 
 
 
211 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  33.17 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.52 
 
 
201 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5374  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  33.33 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.28 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  35.05 
 
 
211 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.14 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.14 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  32.54 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.14 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  34.87 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>