More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5674 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  65.98 
 
 
195 aa  284  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  55.11 
 
 
180 aa  204  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  38.1 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  35.63 
 
 
187 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  38.29 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  34.24 
 
 
208 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  33.68 
 
 
203 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  29.51 
 
 
232 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  32.93 
 
 
237 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  33.15 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  32.94 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.1 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  33.53 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  30.64 
 
 
267 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  35.09 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  32.94 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  32.94 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  33.53 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  32.94 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  31.76 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  34.86 
 
 
237 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  31.18 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  33.15 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  31.95 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  31.95 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  32.76 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  31.55 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  31.25 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  30 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  29.94 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  31.07 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  32.95 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  32.35 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  30.51 
 
 
832 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
288 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  32.18 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.41 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  34.92 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  28.09 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5374  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  32.4 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  34.78 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  28.7 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  31.25 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  30.41 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.25 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  32.75 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  35.88 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  32.39 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  29.69 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
293 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  35.33 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  30.59 
 
 
827 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6008  cytochrome c oxidase, subunit III  31.84 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0674382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2088  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.84 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2069  cytochrome c oxidase, subunit III  31.84 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.08 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  28.1 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  31.17 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  31.84 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.7 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  31.06 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  34.13 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  26.09 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  31.06 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  33.6 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  31.02 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  29.67 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  30.5 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.56 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  27.41 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  29.85 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  34.29 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.28 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  33.33 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.37 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  35.94 
 
 
298 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  27.05 
 
 
284 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>