More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2023 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  34.07 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  35.84 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  33.66 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  29.67 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  29.67 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  27.41 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  33.51 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  25 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  27.92 
 
 		 180 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.26 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  27.4 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  30.98 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  25.79 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  33.54 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  30.32 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  29.7 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  31.47 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  27.23 
 
 		 832 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  28.86 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  30.81 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  23.08 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  25.87 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  29.88 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  27.08 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  35.84 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  32.08 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  24.88 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.64 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.6 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  25.24 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.77 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  30.25 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  26.42 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  30.13 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  30.52 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  26.22 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  30.87 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  33.56 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  24.77 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  31.14 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.74 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.41 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  30.13 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  30.97 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  29.75 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  32.92 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  24.41 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  29.76 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  26.79 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  32.69 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  30.52 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  28.4 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  25.12 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  33.76 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  27.62 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0589  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  30 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  25.11 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  28.5 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  23.98 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  27.95 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  33.76 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  25.57 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  27.14 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  23.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  27.45 
 
 		 194 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  30.38 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  23.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  24.12 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  24.22 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.24 
 
 		 819 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  26.29 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  24.12 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  33.12 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  26.54 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  32.2 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.15 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  30.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0667  quinol oxidase subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0611  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0612  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.67 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  32.08 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  31.85 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  30.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>