More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2592 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  86.92 
 
 		 237 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  60.34 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  51.26 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  39.01 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  43.43 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  40.51 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  36.19 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  46.82 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  46.82 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  42.16 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  45.34 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  43.22 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  48.12 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  45.96 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  43.75 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  43.93 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  42.46 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  34.86 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  33.14 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  39.77 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  32.35 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  32.34 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  35.84 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.45 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  31.16 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  27.93 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  30.2 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  30.57 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  30.16 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  30.81 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.47 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  32.54 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  28.34 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.93 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.93 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  28.21 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.93 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.44 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.86 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  30.96 
 
 		 827 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30.11 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  29.9 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  26.04 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  29.38 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  30.81 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  30.27 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.18 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  29.65 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.77 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  33.59 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  34.07 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  34.19 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.91 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  27.64 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  29.57 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  34.97 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  29.86 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  30.37 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  26.04 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  27.64 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  27.32 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  32.37 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  28.26 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  30.14 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.23 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  29.58 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  28.57 
 
 		 819 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  31.2 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  32.59 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  33.6 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  28.65 
 
 		 825 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  27.41 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  33.81 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  27.53 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  27.83 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  29.37 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  31.08 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  32.41 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  27.81 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  27.68 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  31.09 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  29.92 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  30.08 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>