More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3993 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 187 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  30.43 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  29.55 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  27.93 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  29 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  31.95 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  26.44 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  22.47 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  28.89 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  28.33 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  24.44 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  27.23 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  26.06 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  28.8 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  25.88 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  27.64 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  27.01 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  27.01 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  28 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  26.76 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  28.17 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  25.71 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  28.07 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  27.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  33.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  33.59 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  24.46 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  26.56 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  27.46 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  27.68 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  26.76 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  29.75 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  26.76 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  26.97 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  28.25 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  24.86 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  28.12 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  24.71 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  29.13 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  27.53 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  31.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  25.13 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  26.55 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  28.35 
 
 		 291 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  26.52 
 
 		 796 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  26.29 
 
 		 950 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  27.94 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  25.63 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  26.29 
 
 		 962 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  27.22 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  26.14 
 
 		 974 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  27.62 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  27.94 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  24 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  26.11 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  27.94 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  29.01 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  30.56 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.77 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  26.83 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  27.33 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  24.71 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  33.59 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  25.41 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  28.12 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  26.18 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  27.21 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  23.81 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  28.74 
 
 		 743 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  24.65 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  25.3 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  24.6 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  26.21 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  28.36 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  32.79 
 
 		 259 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  27.21 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  23.28 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  28.9 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  23.94 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  29.63 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.98 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  24.1 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  28.04 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  30.15 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>