More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01170 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  55.68 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  39.77 
 
 		 180 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  40.98 
 
 		 187 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  36.7 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  32.45 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  40.8 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.53 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  37.04 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  31.97 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  37.6 
 
 		 287 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 		 298 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  31.01 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  37.4 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  32.05 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  31.33 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  38.24 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  26.92 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  37.6 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  37.6 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  31.12 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  36.03 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  37.6 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  34.85 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  34.85 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  34.25 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.32 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  33.57 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  36.8 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  34.97 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  37.23 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  31.34 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  37.23 
 
 		 285 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  36.8 
 
 		 285 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  33.54 
 
 		 270 aa  72  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  34.13 
 
 		 294 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  36 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  32.87 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  35.2 
 
 		 284 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  35.2 
 
 		 284 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 		 274 aa  72  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  33.57 
 
 		 292 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  32.58 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  33.53 
 
 		 293 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  34.4 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  32.53 
 
 		 293 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.47 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  36 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  27.04 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  27.07 
 
 		 832 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  32.34 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  34.27 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  34.27 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  34.35 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  36.51 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  37.6 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  32.58 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  36.3 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  28.33 
 
 		 882 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  29.1 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0269  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.11 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  32.73 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  32.87 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  34.01 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  34.85 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  30.34 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  30.25 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  33.6 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  36.5 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  31.29 
 
 		 293 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  31.06 
 
 		 293 aa  67.8  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  32.12 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  34.06 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  32.58 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  34.06 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  31.9 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 		 291 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>