More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1659 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  56.77 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  39.77 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  39.78 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  31.96 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  31.44 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  30.57 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  30.43 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  26.9 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.01 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  35.16 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  27 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  27.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  29.03 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  26.34 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  24.34 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  27.06 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  27.56 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  26.86 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  25.44 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  31.3 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.4 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  32.37 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  24.43 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  28.79 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  27.01 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  25 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  26.62 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  28.79 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  27.78 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  27.43 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  28.03 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  28.03 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  26.86 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  25.41 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.64 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  28.99 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  26.86 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  28.03 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  26.86 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  28.03 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  31.11 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  28.03 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  29.63 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  25.43 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  29.01 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  28.78 
 
 		 294 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.57 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  25.95 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  23.7 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.95 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.95 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  29.6 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0269  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.29 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  25.9 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.01 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  26.19 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.55 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  26.29 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  26.52 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  25.27 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  26.62 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  31.2 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  29.71 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  27.5 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  26.38 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  27.1 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.86 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  30.4 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.37 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.77 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  32.03 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  29.63 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  30.88 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  26.81 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.77 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  24.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  28.41 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>