More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0298 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  36.7 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  38.29 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  36.32 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  35.11 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  33.53 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.94 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  29.06 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  31.64 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  29.94 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  30.91 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.41 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  27.37 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  28.86 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  28.79 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.08 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  26.58 
 
 		 950 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  31.3 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  29.32 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  26.58 
 
 		 974 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  30.61 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  25.13 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  26.58 
 
 		 962 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  25.38 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.78 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  29.08 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  32.56 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  25.13 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.51 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  24.23 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  33.08 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  26.44 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3534  cytochrome c oxidase, subunit III  31.07 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  29.07 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  24.7 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  32.77 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  28.8 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.21 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  29.17 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  27.82 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.21 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  27.23 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  31.5 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  30.5 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  27.82 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.73 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  25.7 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  24.39 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  28 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  28.67 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  27.04 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.25 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  27.36 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  29.69 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  29.88 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  27.66 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  29.88 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  25.74 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  26.67 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  26.98 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  28.36 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  24.88 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  26.56 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.33 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  29.65 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  26.56 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.17 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  29.05 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  28.68 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  27.06 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  29.9 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  27.37 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  28 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  32.08 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1211  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.74 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>