259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4112 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  48.17 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  29.06 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  29.63 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  27.66 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  31.34 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  29.83 
 
 		 235 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  30.51 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  29.76 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  28.37 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  28.49 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  31.47 
 
 		 291 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  33.1 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  32.39 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  32.19 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  28.87 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  33.11 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  29.23 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  33.56 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  30.57 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  25.42 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  26.09 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  30.61 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  33.78 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  28.73 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  28.87 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  29.61 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  31.29 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  29.25 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  31.69 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  31.29 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  26.82 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  26.42 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  26.52 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.7 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  30.77 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  23.9 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  27.81 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.73 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  26.76 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  24.51 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.57 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  27.97 
 
 		 304 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  27.23 
 
 		 283 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  22.06 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  27.94 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  27.06 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  26.76 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  24.63 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  26.76 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  22.73 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  29.23 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  24.73 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  22.61 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  24.18 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  26.95 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  24.14 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  26.95 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  25.31 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.78 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  31.03 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  25.31 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  24.14 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  26.77 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  24.63 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  24.63 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  23.3 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  25.56 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.67 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0269  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  23.96 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  23.3 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5011  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  24.18 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565569  normal  0.0682866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  26.09 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  22.06 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  25.49 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  24.14 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  22.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  22.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  29.13 
 
 		 819 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  22.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>