212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5128 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  100 
 
 		 209 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  65.79 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  58.21 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  57.59 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  54.84 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  51.6 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  45.56 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  45.64 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  43.24 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  43.24 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  42.54 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  47.31 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  47.31 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  45.95 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  46.7 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  43.43 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  41.99 
 
 		 267 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  43.62 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  29.12 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  27.66 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  28.41 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  29.05 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  31.5 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  27.69 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.94 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  30.06 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  35.22 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  30.56 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  25.78 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  31.5 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.53 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  29.69 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  32.82 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  28.67 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  33.59 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  32.84 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  31.06 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  24.35 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  27.96 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  28.22 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.38 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  31.06 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  25.91 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.31 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.66 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  26.4 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  27.84 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  24.88 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.39 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  33.71 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  23.68 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  23.68 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  33.08 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  34.07 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  26.4 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  33.08 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  29.12 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  23.81 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  26.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  28.64 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  25.25 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  27.14 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  24.08 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  28.12 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  26.56 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  36.26 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  26.19 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  28.24 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  28.79 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.46 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  27.89 
 
 		 832 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  29.23 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  25.26 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 		 283 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  28.03 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  29.87 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  24.14 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  23.84 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  25.74 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  24.75 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  24.24 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  25.76 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  24.06 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>