266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3896 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  100 
 
 		 267 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  59.55 
 
 		 233 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  38.2 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  43.1 
 
 		 202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  33.96 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  36.16 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  36.19 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  38.97 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  38.5 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  41.99 
 
 		 209 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  37.29 
 
 		 202 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  29.48 
 
 		 195 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  41.25 
 
 		 203 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  30.64 
 
 		 196 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  38.18 
 
 		 203 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  40.62 
 
 		 203 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  37.11 
 
 		 222 aa  85.5  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  38.12 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  34 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  34 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  30.46 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  27.52 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  29.76 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  30.34 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  25.6 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.43 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.32 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  28.98 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  29.07 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  30.6 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  25.14 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  22.44 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  27.64 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  28.14 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  26.9 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  26.9 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.22 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  27.23 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  29.05 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  24.26 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  25.7 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  29.71 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  28.25 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  28.04 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  26.14 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  26.26 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  26.7 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  24.59 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  29.14 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  26.84 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  26.46 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  25.14 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  29.5 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  26.13 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.22 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  28.34 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  27.55 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  27.78 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  25.2 
 
 		 199 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  25.73 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  25.2 
 
 		 199 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.11 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.9 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  26.94 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  25.96 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  27.92 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.01 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  27.91 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.9 
 
 		 202 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  29.71 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.97 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  25.33 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.09 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.97 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  27.01 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.23 
 
 		 211 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  24.4 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  24.62 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  23 
 
 		 204 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  25 
 
 		 198 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  25.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  26.59 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  26.04 
 
 		 205 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  23.73 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  23.73 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  24.29 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  25.47 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  24.28 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>