More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2343 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
202 aa  393  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  44.22 
 
 
215 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  43.15 
 
 
232 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  45 
 
 
222 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  43.65 
 
 
235 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
237 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  47.34 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  47.93 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  43.1 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  43.98 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  48.45 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  44.79 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  43.43 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  41.9 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  41.9 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  43.53 
 
 
202 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  32.6 
 
 
195 aa  111  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  37.16 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  34.58 
 
 
229 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.32 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  32.02 
 
 
202 aa  91.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  31.4 
 
 
187 aa  88.6  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  32.18 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.7 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  32.18 
 
 
199 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  33.53 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.57 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.21 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.31 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  32.82 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.67 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  34.92 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  35.94 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  30.85 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  28 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  27.27 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.28 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  34.71 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.73 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  28.65 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  29.61 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  32.06 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  31.02 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  32.17 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  32.69 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  32.82 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  28.65 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.79 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  32.81 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  31.06 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  32.17 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  30.3 
 
 
832 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  25.37 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  32.58 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  31.64 
 
 
819 aa  65.1  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  28.4 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  32.17 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  29.28 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  31.95 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  32.58 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.85 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.7 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.31 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  32.84 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.25 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  29.65 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  28.19 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  26.14 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  29.17 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  25.84 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  33.08 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  30.17 
 
 
827 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.25 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  26.37 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  32.87 
 
 
211 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  28.16 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  26.4 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  27.45 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>