More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0439 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  35.05 
 
 
254 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  36.07 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  34.31 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  33.7 
 
 
180 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
187 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  33.89 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  31.86 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  32.98 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  31.37 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.07 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  34.64 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  33.33 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  29.94 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  32.37 
 
 
832 aa  75.9  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.52 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  29.22 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  32.2 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  33.15 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.86 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  31.37 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.24 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  32.04 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30.05 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  34.56 
 
 
743 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  32.21 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  31.53 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  28.37 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  31.37 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  30.88 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.64 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  30.88 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  29.57 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.6 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.77 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.52 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  30.54 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  29.8 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  29.38 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.9 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  29.84 
 
 
208 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  29.03 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  28.77 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  30.89 
 
 
181 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  32.6 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  31.91 
 
 
180 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  32.84 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  29.05 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  30.69 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  28.43 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  31.29 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.44 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.44 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  29.28 
 
 
798 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  28.43 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  27.72 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  27.17 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  28.87 
 
 
293 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  27.36 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  25 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.99 
 
 
293 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.37 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  30.43 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  27.59 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  30.99 
 
 
293 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.26 
 
 
819 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  25.49 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  26.84 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  28.43 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.35 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  25.78 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  29.36 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  25.13 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  27.83 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  30.18 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.27 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.42 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  28.23 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  27.22 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  27.98 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>