286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2476 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  53.36 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  52.54 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  51.26 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  44.02 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  44.83 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  46.02 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  48.8 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  48.78 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  43.85 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  43.85 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  33.96 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  44.83 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  42.46 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  40 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  42.54 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  42.69 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  34.25 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  43.64 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  35.59 
 
 		 180 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  33.73 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  33.15 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  30 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  28.07 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  30.91 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30.34 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  29.83 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.79 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  28.14 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.94 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  34.25 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  32.88 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  26.13 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  33.56 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  28.74 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  27.75 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  27.75 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  28.22 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  27.27 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  27.27 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  27.91 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  29.63 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.65 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  32.88 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.9 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  26.32 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  32 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  26.21 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  26.18 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  35.56 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  31.25 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  30.89 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  28.74 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  25.71 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  29.08 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.06 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  31.54 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  36.17 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  32.21 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  28.34 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  32.08 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  29.46 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  30.86 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  31.19 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.86 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  30.66 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  29.86 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  29.76 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  25.13 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0257  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.75 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 294 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  29.03 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  34.83 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  31.45 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  31.45 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  31.45 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  29.77 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  32.21 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  32.21 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  32.21 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  27.47 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  29.63 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  29.63 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.18 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  28.29 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.8 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.38 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  28.96 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  31.32 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  30.95 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>