More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1880 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
319 aa  624  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  51.44 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  47.88 
 
 
298 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  32.79 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  42.61 
 
 
208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  32.3 
 
 
291 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  31.16 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  30.14 
 
 
286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  38.51 
 
 
211 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  45.52 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  33.45 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  47.41 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  43.28 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  31.74 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  46.27 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  45.52 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  46.27 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  44.78 
 
 
293 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  44.78 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  31.29 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  32.2 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 
294 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  44.78 
 
 
291 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  44.78 
 
 
291 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  29.39 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  32.75 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  30.74 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  44.03 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  32.79 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  40.4 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  39.44 
 
 
197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  45.52 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  42.38 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  42.38 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  42.38 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  30.95 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  31.8 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  33.09 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  32.31 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  29.26 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  31 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  34.17 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  42.38 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  42.38 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  31.1 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  41.72 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.93 
 
 
207 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  37.22 
 
 
198 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.26 
 
 
195 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  37.21 
 
 
208 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.57 
 
 
205 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.57 
 
 
205 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  30.95 
 
 
295 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  31.56 
 
 
293 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  33.81 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  36.78 
 
 
214 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  37.93 
 
 
206 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  32.39 
 
 
293 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  43.28 
 
 
291 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  32.73 
 
 
285 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  31.98 
 
 
293 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  40.4 
 
 
285 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  29.96 
 
 
293 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 
284 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  29.96 
 
 
293 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  28.27 
 
 
288 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  37.09 
 
 
286 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  30.39 
 
 
293 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  37.09 
 
 
286 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  37.09 
 
 
286 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  38.41 
 
 
286 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  41.54 
 
 
288 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  33.05 
 
 
290 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
208 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  29.33 
 
 
298 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  39.07 
 
 
293 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  42.54 
 
 
291 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 
293 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  39.61 
 
 
293 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
283 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  30.07 
 
 
295 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  30.07 
 
 
274 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  41.67 
 
 
798 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  31.88 
 
 
284 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.45 
 
 
204 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  36.93 
 
 
210 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  34.65 
 
 
206 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  39.85 
 
 
293 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  42.86 
 
 
294 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 
283 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>