More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1788 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
208 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  52.74 
 
 
202 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  52.88 
 
 
199 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  53.89 
 
 
201 aa  222  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  49.03 
 
 
201 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  45.05 
 
 
206 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  42.27 
 
 
243 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  40.64 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.83 
 
 
201 aa  117  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  35.96 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.79 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 
194 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  40.88 
 
 
190 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  36.5 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.5 
 
 
197 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  32.46 
 
 
203 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.18 
 
 
174 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.27 
 
 
193 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  41.38 
 
 
175 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  34.03 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.28 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  30.85 
 
 
219 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.17 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  27.7 
 
 
234 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  31.61 
 
 
200 aa  92  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  27.19 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  30.61 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  28.27 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  32.65 
 
 
192 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  27.75 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  27.75 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29.3 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  37.78 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  37.57 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  32.22 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.22 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.22 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  33.16 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  32.22 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  29 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  29 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0269  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.19 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.67 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.67 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  32.61 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  28.23 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  28.36 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  30.9 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  30.3 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  27.72 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  35.38 
 
 
293 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  24.56 
 
 
262 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  35.38 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  27.91 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  28.23 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  28.23 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  31.49 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  27.94 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  31.07 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  35.38 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  35.94 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  26.58 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  27.59 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  26.74 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  28.91 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  32.83 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  32.56 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  28.97 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  29.29 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  29.13 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  26.96 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.09 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  32.31 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  36.88 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  27.98 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  32.68 
 
 
293 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  32.31 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  26.96 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  29.09 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  32.31 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  29.89 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  38.93 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  33.59 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  29.29 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  29.29 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  35.38 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  29.29 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>