More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4156 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  56.99 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  43.55 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  41.83 
 
 		 243 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  42.86 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  43.41 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  40.64 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  41.53 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  38.59 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  33.7 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  37.36 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.52 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  36.02 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.9 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  32.79 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  32.45 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  30.39 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  29.32 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  32.09 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  34.21 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  34.22 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  28.95 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  28.95 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  28.95 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  32.04 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  28.93 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.72 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  28.7 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  28.7 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  29.44 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.44 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.44 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  29.44 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  31.02 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  30.94 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.89 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  35.98 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  28.89 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  25.93 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  29.74 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  29.74 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  29.74 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  32.42 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  28.37 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 262 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  35.91 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  32.93 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  32.76 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  28.93 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  27.66 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  29.9 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.5 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  33.54 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  32.57 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  25.46 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  28.22 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  32.58 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  32.16 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  28.71 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  32.76 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  32.76 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  24 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  31.44 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  27.09 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.24 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  31.21 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  28.32 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  33.7 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  31.4 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  33.91 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  31.21 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  26.97 
 
 		 819 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  28.14 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.11 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  29.55 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  28.89 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  29.89 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  25.44 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  27.67 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  29.41 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  24.49 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  27.82 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  24.85 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  31.76 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>