More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4376 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
193 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
193 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
193 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  71.65 
 
 
194 aa  259  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  72.02 
 
 
193 aa  254  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  48.33 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  48.33 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  47.78 
 
 
209 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  47.78 
 
 
209 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  47.78 
 
 
209 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  47.78 
 
 
209 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  43.96 
 
 
203 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  43.01 
 
 
200 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  37.89 
 
 
204 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  44.44 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  37.17 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.68 
 
 
174 aa  128  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 
198 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 
198 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  36.26 
 
 
198 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  37.71 
 
 
196 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  38.12 
 
 
192 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.95 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  39.01 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  32.42 
 
 
212 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  33.69 
 
 
243 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  37.1 
 
 
224 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  43.33 
 
 
198 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  37.23 
 
 
197 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
209 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.32 
 
 
206 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
209 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  32.66 
 
 
209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  37.31 
 
 
209 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  34.59 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  36.17 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  36.9 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  37.7 
 
 
190 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  32.05 
 
 
234 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  31.62 
 
 
234 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  34.55 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.32 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  36.51 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  35.36 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  30.21 
 
 
235 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  35.68 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  39.78 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.65 
 
 
234 aa  92.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 
203 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.46 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  30.85 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  37.37 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.75 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  30.04 
 
 
259 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.27 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  34.16 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  35.52 
 
 
202 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  35.52 
 
 
202 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  37.36 
 
 
175 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  35.52 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.58 
 
 
211 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  36.87 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  34.16 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  35.52 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.05 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5791  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.07 
 
 
226 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0858154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  36.81 
 
 
184 aa  87.8  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  33.65 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  33.66 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  35.52 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
241 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.34 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.34 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  32.71 
 
 
239 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  30.21 
 
 
240 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.21 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  29.78 
 
 
217 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 
239 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  32.6 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4577  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  31.31 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.19 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  32.69 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  29.03 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.69 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  33.69 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  27.8 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3534  cytochrome c oxidase, subunit III  30.46 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  34.57 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  32.02 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  32.46 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  33.69 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  35.63 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>