More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3118 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
191 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  46.55 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  45.03 
 
 
204 aa  167  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  42.25 
 
 
201 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  47.28 
 
 
197 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  46.56 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  42.47 
 
 
212 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  44.26 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.21 
 
 
205 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  36.98 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  38.3 
 
 
200 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  36.41 
 
 
203 aa  120  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  36.11 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  34.03 
 
 
193 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  34.03 
 
 
193 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  34.03 
 
 
193 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  36.76 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  43.68 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  34.38 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  35.94 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  34.55 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  36.56 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  35.39 
 
 
196 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  37.3 
 
 
199 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 
208 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  32.47 
 
 
193 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
209 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  32.81 
 
 
209 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  32.81 
 
 
209 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 
209 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
209 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 
209 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  38.89 
 
 
184 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  32.81 
 
 
209 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 
199 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.78 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.78 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  30.53 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  33.7 
 
 
201 aa  99  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  36.32 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  34.69 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  34.92 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  30.41 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  34.02 
 
 
224 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 
298 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  29.26 
 
 
211 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  30.88 
 
 
235 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 
234 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  35.71 
 
 
296 aa  91.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 
295 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
295 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  34.86 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  30.39 
 
 
234 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  30.93 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  35.76 
 
 
295 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 
295 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  35.06 
 
 
295 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  33.76 
 
 
295 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  30.69 
 
 
189 aa  88.2  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  33.12 
 
 
295 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  28.86 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  32.57 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.77 
 
 
295 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  28.36 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  28.36 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  37.43 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  31.76 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  31.84 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  37.59 
 
 
271 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  34.81 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  30.12 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.11 
 
 
819 aa  79  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  32.93 
 
 
291 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  36.81 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.37 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  33.52 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  27.72 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  35.51 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  36.96 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  32.93 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  27.14 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.9 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  33.8 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  27.41 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  32.98 
 
 
832 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  26.09 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  34.09 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  35.42 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>