More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2527 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 
199 aa  229  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  56.85 
 
 
199 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  60.61 
 
 
199 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  58.29 
 
 
200 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  55.61 
 
 
198 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  51.52 
 
 
199 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  54.4 
 
 
209 aa  188  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  55.44 
 
 
200 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  46.19 
 
 
224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  44.33 
 
 
226 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  45.32 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  44.06 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  44.06 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  41.36 
 
 
225 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  40.61 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  38.81 
 
 
234 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  40.53 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  39.6 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  34.12 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  40.21 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  39.6 
 
 
229 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  33.91 
 
 
259 aa  121  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  35.47 
 
 
214 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  37.69 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  36.63 
 
 
234 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  36.14 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  38.86 
 
 
832 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  37.82 
 
 
209 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  32.92 
 
 
262 aa  115  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  38.97 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  39.27 
 
 
229 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  36.18 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
219 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.98 
 
 
205 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.76 
 
 
194 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.24 
 
 
174 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.57 
 
 
243 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  35.64 
 
 
819 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  30.88 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  37.37 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  35.2 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  32.5 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  34.83 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  33.69 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  30.48 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  38.54 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.02 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  35.48 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  35.87 
 
 
184 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  31.89 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.08 
 
 
215 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  37.07 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  35.96 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  30.14 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 
825 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.08 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  36.89 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.33 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.99 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  32.16 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.39 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.73 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  32.5 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  36.59 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.8 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  32.8 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.64 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  32.51 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.65 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  32.12 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.47 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  31.34 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  32.52 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.84 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  33.33 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  32.8 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  29.85 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5791  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.68 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0858154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  31.19 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  31.12 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.47 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>