More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4060 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  99.52 
 
 
207 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  99.52 
 
 
207 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  99.52 
 
 
207 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  99.52 
 
 
207 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2644  cytochrome c oxidase subunit III  97.1 
 
 
207 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.252638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  80.68 
 
 
206 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  77.78 
 
 
206 aa  329  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  50.51 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  47.64 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  47.64 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0161  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  48.31 
 
 
202 aa  175  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  47.12 
 
 
201 aa  175  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  46.04 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.54 
 
 
204 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3243  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  44.55 
 
 
204 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3062  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  44.55 
 
 
204 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119037  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3100  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  44.55 
 
 
204 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  45.45 
 
 
211 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  46.15 
 
 
200 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45 
 
 
204 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45 
 
 
204 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45 
 
 
204 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0480  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45 
 
 
204 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0470237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0488  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45 
 
 
204 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128023  hitchhiker  0.00584206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  46.7 
 
 
199 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  43.37 
 
 
215 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  43.37 
 
 
215 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0514  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128074  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0956  cytochrome c oxidase, subunit III  46.74 
 
 
205 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00381  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00313759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3179  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000613684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  44.06 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0470  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0234669  normal  0.574469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3203  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.350739  hitchhiker  0.0000785376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0505  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00786861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00385  hypothetical protein  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0465  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.5 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  45.18 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  41.63 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  43.06 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  47.4 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  46.23 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  46.7 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  42.36 
 
 
208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  47.8 
 
 
204 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.5 
 
 
204 aa  161  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  45.73 
 
 
200 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  45.86 
 
 
214 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  45.83 
 
 
210 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  46.88 
 
 
211 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  46.15 
 
 
202 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.74 
 
 
221 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1546  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.75 
 
 
221 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  44.16 
 
 
209 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  46.7 
 
 
212 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  45.88 
 
 
209 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1875  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.75 
 
 
221 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0147055  normal  0.117743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0667  quinol oxidase subunit III  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0611  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0612  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  41.43 
 
 
210 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0589  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  45.23 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  44.33 
 
 
210 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  42.51 
 
 
215 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  42.79 
 
 
209 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  42.93 
 
 
218 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  44.44 
 
 
211 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.44 
 
 
213 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.44 
 
 
209 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  45.03 
 
 
202 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  46.15 
 
 
203 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  46.59 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  43.65 
 
 
217 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  46.59 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0269  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  41.95 
 
 
203 aa  154  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  43.5 
 
 
209 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  44.74 
 
 
209 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  44.74 
 
 
209 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  43 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0837  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.92 
 
 
208 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900518  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0814  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.92 
 
 
207 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.692296  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  40.8 
 
 
214 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0851  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.92 
 
 
208 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  41.67 
 
 
208 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  45.05 
 
 
205 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  39.15 
 
 
210 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  43.65 
 
 
215 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4374  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  44.39 
 
 
207 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  43.23 
 
 
205 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>