More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1614 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1614  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.250023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0512  regulatory protein GntR, HTH  58.6 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  36.42 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  36.42 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.4 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  34.81 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  34.81 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.81 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  34.81 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  31.73 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.85 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  38.71 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.18 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.18 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.18 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.18 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  34.18 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.47 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  38.36 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.39 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.5 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.48 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3146  regulatory protein GntR HTH  27.69 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000023856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  45.24 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.54 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.54 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.54 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  35.44 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.54 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.54 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  33.52 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0921  regulatory protein GntR HTH  24.41 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.888898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  30.92 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  44.19 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.54 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  28.95 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  32.35 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  46.27 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  50.68 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1711  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00570567  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  48.53 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  30.88 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  32.1 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  33.14 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  33.14 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  47.37 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  46.58 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3660  GntR-like  41.89 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  28.21 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.52 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  51.61 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  27.22 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  27.22 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  26.37 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  27.22 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  27.22 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  42.65 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  44.16 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.79 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  29.46 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01468  putative regulatory protein, GntR family  38.54 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>