More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3015 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  100 
 
 
441 aa  897    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  72.73 
 
 
440 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  66.74 
 
 
442 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  67.65 
 
 
442 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  55.23 
 
 
455 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  55.46 
 
 
455 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  55.23 
 
 
455 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  54.99 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.26 
 
 
431 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.26 
 
 
431 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.26 
 
 
431 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.13 
 
 
431 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.26 
 
 
431 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.41 
 
 
431 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  52.41 
 
 
431 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  52.41 
 
 
431 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  52.64 
 
 
431 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  52.41 
 
 
431 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.41 
 
 
431 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.64 
 
 
431 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  52.41 
 
 
431 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  52.41 
 
 
431 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  51.38 
 
 
431 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  45.58 
 
 
440 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  43.65 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.82 
 
 
435 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  40.28 
 
 
435 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  36.78 
 
 
427 aa  256  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  36.42 
 
 
460 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  37.38 
 
 
452 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  37.05 
 
 
414 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  36.74 
 
 
452 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  37.26 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  36.84 
 
 
452 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  38.1 
 
 
452 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  37.5 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  37.62 
 
 
452 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  36.41 
 
 
452 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  36.41 
 
 
452 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  38.35 
 
 
452 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  36.65 
 
 
452 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  36.41 
 
 
452 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  34.95 
 
 
452 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  33.41 
 
 
475 aa  209  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  35.08 
 
 
466 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  34.01 
 
 
432 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  31.18 
 
 
471 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  30.42 
 
 
482 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  30.61 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  32.19 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32 
 
 
473 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  30.55 
 
 
477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  35.11 
 
 
451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  34.2 
 
 
473 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  33.62 
 
 
471 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.72 
 
 
485 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.14 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.14 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.44 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.71 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.58 
 
 
452 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.31 
 
 
554 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  31.8 
 
 
471 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  34.65 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.03 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.21 
 
 
481 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  31.12 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  36.08 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.25 
 
 
445 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.9 
 
 
451 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  36.86 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  35.14 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  34.85 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.4 
 
 
481 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  33.82 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.63 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  32.64 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  37.34 
 
 
259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  38.43 
 
 
506 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.54 
 
 
484 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.87 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  29.94 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  29.13 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.03 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.03 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  34.01 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  33.45 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.05 
 
 
476 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  31.66 
 
 
391 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  34.78 
 
 
473 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  34.87 
 
 
407 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  32.84 
 
 
398 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.12 
 
 
477 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  34.96 
 
 
490 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.63 
 
 
476 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.63 
 
 
476 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  33.33 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  30.26 
 
 
359 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3023  anthranilate synthase component I  31.18 
 
 
505 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594824  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0228  anthranilate synthase  35.11 
 
 
515 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>