More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2823 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  100 
 
 
444 aa  888    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.95 
 
 
482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.83 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  34.17 
 
 
461 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.31 
 
 
460 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  30.79 
 
 
469 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  38.27 
 
 
495 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.65 
 
 
481 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  32.43 
 
 
445 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.15 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  29.72 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  40.08 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.47 
 
 
476 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.73 
 
 
451 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.22 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  29.44 
 
 
492 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  32.41 
 
 
506 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  38.61 
 
 
483 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.27 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  35.06 
 
 
451 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.05 
 
 
464 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.98 
 
 
464 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.98 
 
 
464 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  29.11 
 
 
473 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.05 
 
 
464 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.98 
 
 
464 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.04 
 
 
477 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  34.66 
 
 
490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.74 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.74 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  29.74 
 
 
498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  29.95 
 
 
455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.95 
 
 
455 aa  136  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.95 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.37 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  36.23 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  33.46 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.51 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  30.75 
 
 
451 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.72 
 
 
484 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.62 
 
 
471 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.72 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  31.08 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  29.55 
 
 
468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.82 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  30.07 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  35.62 
 
 
403 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  30.83 
 
 
486 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  29.18 
 
 
452 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.3 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
440 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.09 
 
 
452 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  27.4 
 
 
464 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  34.77 
 
 
505 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.96 
 
 
414 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  38.46 
 
 
368 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  28.33 
 
 
418 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  35.36 
 
 
452 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  34.22 
 
 
452 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  27.95 
 
 
409 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  28.63 
 
 
452 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  34.8 
 
 
460 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  29.29 
 
 
554 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  32.23 
 
 
452 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  32.85 
 
 
406 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.1 
 
 
471 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  36.59 
 
 
377 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  35.02 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  31.4 
 
 
473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  32.58 
 
 
452 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  32.58 
 
 
452 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  30 
 
 
467 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  30.29 
 
 
432 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  34.73 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.92 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  32.31 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  32.58 
 
 
452 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.92 
 
 
452 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  29.51 
 
 
432 aa  120  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  32.46 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  27.79 
 
 
475 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  36.49 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  34.57 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  33.97 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  32.82 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  34.04 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  36.1 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.92 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  34.04 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.84 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  27.91 
 
 
456 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.21 
 
 
466 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  33.92 
 
 
365 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  32.82 
 
 
482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  34.15 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  33.74 
 
 
466 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.92 
 
 
435 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  28.57 
 
 
471 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>