More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1487 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  100 
 
 
445 aa  872    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  54.48 
 
 
451 aa  428  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  56.75 
 
 
451 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  51.16 
 
 
554 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  43.85 
 
 
452 aa  312  5.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  45.86 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  46.17 
 
 
486 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.73 
 
 
460 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.89 
 
 
473 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  40.5 
 
 
495 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.71 
 
 
481 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.19 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.5 
 
 
471 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  42.5 
 
 
482 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.54 
 
 
492 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.54 
 
 
492 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.43 
 
 
464 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.89 
 
 
464 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.43 
 
 
464 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.23 
 
 
464 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  37.69 
 
 
461 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.06 
 
 
476 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.23 
 
 
464 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.45 
 
 
464 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40 
 
 
469 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  33.02 
 
 
498 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.23 
 
 
464 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.01 
 
 
464 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.01 
 
 
464 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.23 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  34.95 
 
 
471 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.35 
 
 
476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40 
 
 
477 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  36.7 
 
 
506 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  36.69 
 
 
467 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.78 
 
 
476 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.78 
 
 
476 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  36.82 
 
 
415 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  36.59 
 
 
485 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  33.5 
 
 
475 aa  206  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.64 
 
 
484 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.64 
 
 
484 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.64 
 
 
492 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  32.14 
 
 
471 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  37.47 
 
 
467 aa  203  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.23 
 
 
481 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  35.01 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  34.52 
 
 
473 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  39.69 
 
 
407 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  36.87 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.53 
 
 
483 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.18 
 
 
466 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.98 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.98 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  35.1 
 
 
482 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  36.64 
 
 
475 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  33.7 
 
 
456 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  32.21 
 
 
468 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  36.54 
 
 
468 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  37.44 
 
 
428 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  33.99 
 
 
432 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.16 
 
 
452 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  32.61 
 
 
466 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  34.89 
 
 
460 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  32.13 
 
 
466 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  36.16 
 
 
452 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32.86 
 
 
473 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  36.26 
 
 
452 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  35.84 
 
 
449 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.08 
 
 
440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  35.48 
 
 
412 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  34.71 
 
 
452 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  35.81 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.71 
 
 
414 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  35.28 
 
 
473 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  31.64 
 
 
465 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  35.01 
 
 
452 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  33.41 
 
 
462 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  34.73 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  34.73 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  34.45 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  34.9 
 
 
452 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.28 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  33.8 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  34.89 
 
 
452 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  33.11 
 
 
487 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  36.74 
 
 
384 aa  170  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.49 
 
 
435 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  32.94 
 
 
471 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.23 
 
 
435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  33.73 
 
 
435 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  35.96 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  33.01 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  24.4 
 
 
470 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01971  isochorismate synthase  25.36 
 
 
470 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  41.76 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  35.44 
 
 
451 aa  163  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  42.59 
 
 
365 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  44.84 
 
 
394 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01951  isochorismate synthase  24.62 
 
 
470 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>