More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2562 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  100 
 
 		 449 aa  867    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  57.97 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  52.46 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  53.81 
 
 		 409 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  54.48 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  51.56 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  50.23 
 
 		 424 aa  329  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  48.28 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  49.04 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  51.74 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  47.5 
 
 		 413 aa  292  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  46.6 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  42.67 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  43.35 
 
 		 475 aa  269  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  43.96 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  42.89 
 
 		 465 aa  249  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.43 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  39.76 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  39.29 
 
 		 485 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.04 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  47.3 
 
 		 487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 464 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  40.52 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  39.18 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.99 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.34 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  45 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  34.99 
 
 		 464 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.57 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  41.58 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.05 
 
 		 482 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.3 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  42.37 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  49.2 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.67 
 
 		 476 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.74 
 
 		 477 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  38.17 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.67 
 
 		 476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.44 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  45.25 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.01 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.01 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  45.52 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  35.84 
 
 		 445 aa  193  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  37.54 
 
 		 461 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.07 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.07 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.07 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  33.89 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  37.03 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  42.16 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  42.16 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  41.79 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  40.53 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  41.15 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  43.3 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  41.42 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  40.12 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  41.79 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.99 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  36.76 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.36 
 
 		 467 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  37.01 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  33.96 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  45.04 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  41.42 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  33.67 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  41.04 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  47.11 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  41.79 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.71 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  40.67 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  29.13 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.96 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  42.47 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  40.84 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  40.84 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  45.42 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  35.16 
 
 		 495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  41.15 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  41.15 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.4 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  41.15 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  41.15 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  41.15 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  37.83 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  41.98 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  40.87 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  40.87 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  43.48 
 
 		 365 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  42.29 
 
 		 365 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  42.29 
 
 		 365 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>