More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4053 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  74.45 
 
 		 409 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  58.87 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  58.37 
 
 		 407 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  54.48 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  54.26 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  51.86 
 
 		 428 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  53.03 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  50.73 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  50.8 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  49.29 
 
 		 447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  48.14 
 
 		 475 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  47.86 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  51.54 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  47.27 
 
 		 465 aa  289  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  42.15 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  40.48 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.09 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.64 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.25 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.46 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.46 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.51 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.2 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.94 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.2 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.2 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.94 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.2 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.92 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  34.2 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.73 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  47.97 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  37.01 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  39.82 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  39.33 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.92 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.92 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  37.43 
 
 		 469 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.55 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  45.19 
 
 		 481 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.33 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.33 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  45.8 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.33 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.43 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  37.81 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  44.27 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  39.58 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.16 
 
 		 476 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  43.68 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  43.02 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  41.22 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  47.6 
 
 		 394 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  37.32 
 
 		 451 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.25 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.15 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  36.31 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  36.34 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  36.31 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  42.44 
 
 		 403 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  36.31 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  36.31 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  36.31 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  40.84 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  34.57 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  36.14 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  36.14 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  36.14 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  35.54 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  42.41 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  40.88 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.29 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  40.57 
 
 		 486 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.71 
 
 		 498 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  32.6 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.68 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  34.55 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  40.32 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  38.35 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  42.16 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  43.87 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  39.32 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  35.14 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  39.32 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  46.5 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  39.01 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  37.6 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  35.74 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  34.83 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  28.47 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  28.47 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  38.67 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  35.31 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  35.14 
 
 		 399 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>