More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1098 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  100 
 
 		 440 aa  916    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  54.12 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  53.18 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  56.31 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  44.87 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  45.67 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  43.88 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  46.67 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  43.88 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  43.88 
 
 		 455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  43.19 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  44.72 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.37 
 
 		 431 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.68 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.46 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.46 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.46 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  40.72 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  39.5 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  39.28 
 
 		 431 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  39.5 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.28 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  39.28 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  39.28 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.28 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  39.28 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.5 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  39.71 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  39.66 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  40.05 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  39.36 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  39.61 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  39.61 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  39.61 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  39.37 
 
 		 452 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  39.5 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  37.68 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  37.26 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  37.9 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  37.92 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  37.68 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  38.05 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  36.49 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  36.83 
 
 		 432 aa  237  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  33.03 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.5 
 
 		 466 aa  212  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  32.36 
 
 		 468 aa  206  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  34.22 
 
 		 471 aa  206  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  30.18 
 
 		 482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  28.86 
 
 		 471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.48 
 
 		 477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.46 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.69 
 
 		 477 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.51 
 
 		 452 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.24 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.08 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.77 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.77 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  30.73 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.23 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.81 
 
 		 481 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  31.08 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.42 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.97 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.97 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.97 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.05 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  31.59 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  35.98 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  33.24 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.61 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.33 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  30.23 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  38.67 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.94 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.44 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.44 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  29.43 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  29.43 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  30.72 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.07 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  34.16 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.23 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.83 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  30.79 
 
 		 473 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.15 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.71 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.96 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  37.55 
 
 		 259 aa  146  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  32.26 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  33.08 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.25 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.3 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.58 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.58 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>