More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0355 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  100 
 
 		 432 aa  894    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  43.46 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  41.63 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  42.65 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  39.12 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  38.6 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  42.96 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  42.51 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  38.75 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  41.38 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  40.98 
 
 		 414 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  41.38 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  41.38 
 
 		 452 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  41.13 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  40.39 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  41.18 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.83 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  32.34 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  33.87 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.45 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  35.28 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  34.2 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  32.87 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.78 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  33.26 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  37.73 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.73 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  32.52 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  34.13 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.73 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.66 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.66 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.66 
 
 		 431 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.66 
 
 		 431 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.41 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  35 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  33.17 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  34.1 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.99 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.99 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  33.74 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  34.07 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  32.36 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  34.07 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.5 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  33.5 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  33.5 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.5 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  33.5 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  33.52 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  33.42 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  31.27 
 
 		 473 aa  179  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.27 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  31.35 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  29.73 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  30.23 
 
 		 473 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  39.42 
 
 		 473 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  31.68 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.02 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  39.42 
 
 		 492 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  29.4 
 
 		 554 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  39.42 
 
 		 492 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  30.71 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  36.64 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.63 
 
 		 460 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.35 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.84 
 
 		 467 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  35.66 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.01 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  36.89 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  30.7 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.77 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  30.05 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  35.27 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  34.88 
 
 		 471 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  35.06 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.56 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.56 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.01 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.34 
 
 		 464 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.81 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  32.11 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.17 
 
 		 484 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.59 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.74 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  32.32 
 
 		 495 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.74 
 
 		 492 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.41 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.92 
 
 		 464 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.81 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  27.64 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.64 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.64 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  33.08 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  28.34 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  32.57 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  32.08 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.64 
 
 		 464 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>