More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0026 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  84.88 
 
 		 486 aa  757    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  100 
 
 		 455 aa  916    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  45.73 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  40.94 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  40.72 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  39.63 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  39.34 
 
 		 495 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.9 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  38.4 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.9 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.62 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.66 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.49 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.66 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.66 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.4 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  39.42 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.05 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.05 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.05 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.05 
 
 		 464 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.05 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.45 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.81 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.81 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.05 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.41 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  35.46 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.2 
 
 		 483 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  35.16 
 
 		 469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  34.46 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.3 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  34.46 
 
 		 492 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.3 
 
 		 484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.23 
 
 		 498 aa  216  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  35.06 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.05 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.05 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  37.53 
 
 		 409 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  32.43 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  34.06 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.04 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  33.33 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.4 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  38.27 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.94 
 
 		 481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  32.96 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  45.98 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  38.3 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  34.43 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.28 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.21 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.21 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  33.25 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.1 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  34.92 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  37.81 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  32.94 
 
 		 506 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  32.28 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.29 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  30.87 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  40.73 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  29.96 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  33.91 
 
 		 395 aa  186  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  32.41 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  40.53 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.58 
 
 		 379 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  42.11 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.6 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.6 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.53 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.62 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  39.78 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32.48 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  39.1 
 
 		 398 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  30.14 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  40.75 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  37.64 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.37 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  30.18 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  35.31 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  34.69 
 
 		 473 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  35.67 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  34.51 
 
 		 386 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  34.39 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  32.53 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  43.8 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  45.88 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  29.73 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  41.2 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  41.61 
 
 		 390 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  30.02 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  37.74 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  37.74 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  44.36 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  43.14 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>