More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0093 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  67.92 
 
 		 452 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  100 
 
 		 452 aa  943    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  67.7 
 
 		 452 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  85.02 
 
 		 414 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  77.65 
 
 		 452 aa  731    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  65.71 
 
 		 460 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  67.7 
 
 		 452 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  67.92 
 
 		 452 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  76.99 
 
 		 452 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  67.48 
 
 		 452 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  65.93 
 
 		 452 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  66.37 
 
 		 452 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  65.93 
 
 		 452 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  65.71 
 
 		 452 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  65.27 
 
 		 452 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  39.12 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.19 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.66 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  39.61 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.89 
 
 		 435 aa  272  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.54 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.32 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.54 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.54 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.54 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  37.02 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.24 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  36.19 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.18 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  32.25 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.18 
 
 		 455 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  36.95 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  36.34 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  35.25 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.03 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  35.03 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  35.03 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.25 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  35.03 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.03 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  35.03 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  33.04 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  32.24 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  34.81 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  34.88 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  36.25 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  34.51 
 
 		 431 aa  223  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  33.65 
 
 		 473 aa  223  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  32.43 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  31.25 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  34.49 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  30.8 
 
 		 477 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  31.93 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  30.49 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  36.26 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  34.9 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  34.9 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  29.96 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.33 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.39 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  31.72 
 
 		 482 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.55 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.18 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  34.08 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  33.99 
 
 		 469 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  36.12 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.52 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  34.08 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  32.52 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.52 
 
 		 481 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 492 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.44 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.92 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  30.03 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.24 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  31.55 
 
 		 554 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.24 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.24 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  37.24 
 
 		 259 aa  156  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.99 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.99 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  30.96 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  31.05 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  39.18 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  32.22 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.49 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  40.38 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  32.88 
 
 		 384 aa  143  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.01 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.01 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  27.85 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  27 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.45 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.45 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.45 
 
 		 464 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.45 
 
 		 464 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  31.02 
 
 		 506 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>