More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0130 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  72.22 
 
 		 452 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  72.46 
 
 		 452 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  100 
 
 		 414 aa  858    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  72.22 
 
 		 452 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  70.77 
 
 		 460 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  85.02 
 
 		 452 aa  759    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  71.74 
 
 		 452 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  81.4 
 
 		 452 aa  711    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  72.22 
 
 		 452 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  79.71 
 
 		 452 aa  689    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  70.53 
 
 		 452 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  70.29 
 
 		 452 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  70.53 
 
 		 452 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  69.81 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  68.84 
 
 		 452 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  40 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  41.06 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  40.98 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.62 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.71 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.98 
 
 		 466 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  36.43 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  33.73 
 
 		 475 aa  243  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  35.84 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  36.89 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  37.5 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  37.16 
 
 		 431 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  36.92 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  33.66 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  36.67 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.67 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.92 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.17 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  36.67 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.17 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  35.75 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  34.93 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  33.66 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  36.74 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  34.29 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  34.14 
 
 		 473 aa  223  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  35.14 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  33.57 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  32.68 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  34.47 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  34.77 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.78 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.1 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.73 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  32.69 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  33.61 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  33.61 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.73 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.49 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  32.86 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.9 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  34.08 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  35.26 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  39.83 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.73 
 
 		 456 aa  169  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.76 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  33.24 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  33.06 
 
 		 483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.14 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.14 
 
 		 492 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 481 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.31 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.03 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.31 
 
 		 484 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.31 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.88 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.88 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.6 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.36 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.77 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  30.36 
 
 		 467 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.68 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  28.61 
 
 		 461 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.51 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.14 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.14 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.42 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.14 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.14 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  35.98 
 
 		 259 aa  149  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.94 
 
 		 464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.94 
 
 		 464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.94 
 
 		 464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.31 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  35.36 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  33.44 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  31.85 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>