More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27351 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  100 
 
 
505 aa  1020    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  67.1 
 
 
475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  65.16 
 
 
468 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  59.61 
 
 
465 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  48.92 
 
 
466 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  48.28 
 
 
466 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02061  isochorismate synthase  31.81 
 
 
465 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01971  isochorismate synthase  29.61 
 
 
470 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  30.75 
 
 
470 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01951  isochorismate synthase  29.83 
 
 
470 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
471 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.39 
 
 
485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  31.61 
 
 
471 aa  192  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  31.4 
 
 
498 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.81 
 
 
452 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.87 
 
 
492 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.87 
 
 
492 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  34.42 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  30.97 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.01 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  33.58 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.7 
 
 
451 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.35 
 
 
464 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.38 
 
 
464 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.35 
 
 
464 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.54 
 
 
464 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.38 
 
 
464 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.83 
 
 
464 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.05 
 
 
464 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.05 
 
 
464 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.05 
 
 
464 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.05 
 
 
464 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.35 
 
 
451 aa  153  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40.08 
 
 
469 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  31.58 
 
 
554 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  33.98 
 
 
473 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.45 
 
 
464 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.43 
 
 
476 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  31.13 
 
 
483 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40 
 
 
481 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  35.07 
 
 
398 aa  147  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  37.55 
 
 
425 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  35.56 
 
 
398 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  31.37 
 
 
482 aa  146  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  34.17 
 
 
395 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  27.47 
 
 
460 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.41 
 
 
475 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  33.01 
 
 
402 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  30 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  34.35 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  36.51 
 
 
467 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  34.46 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  34.46 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  34.46 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  34.78 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  34.46 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  34.46 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.49 
 
 
477 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  37.55 
 
 
418 aa  140  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  36.26 
 
 
395 aa  140  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.24 
 
 
476 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  35.21 
 
 
391 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  36.58 
 
 
468 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  35.21 
 
 
391 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.31 
 
 
476 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.31 
 
 
476 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  35.21 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  35.21 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  35.21 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  35.21 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  35.21 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  35.21 
 
 
391 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  35.21 
 
 
391 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  31.32 
 
 
486 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.51 
 
 
456 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37.26 
 
 
466 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  35.71 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.57 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  30.66 
 
 
415 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.36 
 
 
481 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  37.4 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  34.59 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  36.25 
 
 
473 aa  134  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  35.53 
 
 
395 aa  134  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  36.4 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  30.94 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.86 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  32.47 
 
 
490 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  32.86 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  32.03 
 
 
406 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  35.1 
 
 
384 aa  130  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  32.59 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  32.82 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  29.23 
 
 
412 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.25 
 
 
484 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.25 
 
 
492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  37.02 
 
 
424 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.25 
 
 
484 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  29.7 
 
 
453 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  29.7 
 
 
453 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>