More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01398 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  843    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  45.75 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  46.94 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  46.11 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  46.11 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  45.6 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  45.85 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  45.09 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  45.85 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  45.85 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  45.08 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  45.6 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  45.6 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  43.7 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  42.41 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  43.15 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  39.42 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  38.6 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.91 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  38.52 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  38.58 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  39.37 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  39.85 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  39.23 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  39.54 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  36.29 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  41.13 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  39.84 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  37.04 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  37.04 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  37.04 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  37.04 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  37.04 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  37.04 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  37.04 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.3 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  37.47 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  37.47 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  39.26 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  37.7 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  37.7 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  37.3 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  37.3 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  37.04 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  37.04 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  44.41 
 
 		 484 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  39.27 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  35.19 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  37.35 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  37.35 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  35.57 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  36.29 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  37.1 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  35.14 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  41.42 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  42.91 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  36.7 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  46.51 
 
 		 503 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  40.48 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  41.53 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  33.96 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  40.32 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  35.78 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.69 
 
 		 464 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  38.22 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.34 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.6 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  40.54 
 
 		 495 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  39.52 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  38.34 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  34.39 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  37.6 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  38.89 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  38.8 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.73 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  37.91 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.9 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.9 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  35.17 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.68 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.45 
 
 		 481 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  29.05 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  34.54 
 
 		 464 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  35.06 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.96 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.54 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.09 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  36.4 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.34 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  35.84 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.08 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.51 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>