More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0536 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  100 
 
 		 469 aa  922    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  59.09 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  59.23 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  58.48 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  55.2 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  57.28 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  50.73 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  46.34 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  50.73 
 
 		 412 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  47.79 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  49.52 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  45.51 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  47.87 
 
 		 449 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  47.6 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  43.72 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  42.89 
 
 		 487 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  44.11 
 
 		 425 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  38.3 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.43 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.51 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.93 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.27 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.27 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.95 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.27 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.11 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.11 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.27 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.93 
 
 		 464 aa  200  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  39.78 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  42.91 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  40.29 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.49 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  40.7 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  43.45 
 
 		 401 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  41.33 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  46.56 
 
 		 414 aa  180  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  32.68 
 
 		 461 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  40 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  40.43 
 
 		 403 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  40.59 
 
 		 399 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  41.61 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  40.37 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  40.37 
 
 		 399 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  40.74 
 
 		 399 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  40.37 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  40.37 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  40.37 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.99 
 
 		 467 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  35.48 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.52 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  42.97 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.7 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  32.4 
 
 		 495 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.24 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  40.88 
 
 		 390 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  37.12 
 
 		 402 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  39.86 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.15 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.15 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  38.34 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.58 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.15 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  37.36 
 
 		 395 aa  163  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.84 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 391 aa  160  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  37.26 
 
 		 395 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 391 aa  160  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  28.69 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  29.51 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  32.08 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.2 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.2 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.14 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  45.21 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  28.21 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  28.21 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  41.04 
 
 		 376 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  39.92 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.49 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.04 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.04 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  35.69 
 
 		 391 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.33 
 
 		 554 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.17 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  35.47 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  35.47 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  35.47 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  31.42 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  35.47 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  34.34 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  34.69 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  35.88 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  39.1 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  36.26 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>