More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3400 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  100 
 
 		 421 aa  867    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  46.25 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  41.9 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  42.89 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  54.09 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  42.39 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  41.75 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  41.98 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  42 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  42 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  41.75 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  41.22 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  42 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  42 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  41.75 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  40.98 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  40.39 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  39.54 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  37.24 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40.54 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  40.15 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  39.4 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  38.46 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  37.73 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  37.08 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  36.77 
 
 		 484 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  40.55 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  39.54 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  39.54 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  40.05 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  41.09 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  37.4 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  37.4 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.4 
 
 		 391 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  37.31 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  37.31 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  36.11 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  36.13 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  36.11 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  36.11 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  36.11 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  36.53 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  36.11 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  39.6 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  36.53 
 
 		 391 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  36.53 
 
 		 391 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  36.08 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  38.13 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  44.82 
 
 		 397 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  39.05 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  37.57 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  38.42 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  40 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  38.25 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  40 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  38.1 
 
 		 407 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  42.07 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  45.1 
 
 		 503 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  36.2 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  38.29 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  38.04 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  35.4 
 
 		 554 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.73 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.5 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  37.09 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  36.8 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  37.14 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  36.07 
 
 		 495 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  35.9 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  34.57 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  29.4 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  36.59 
 
 		 486 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  35.42 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  35.04 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.71 
 
 		 464 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.95 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.95 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.74 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.16 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.03 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.03 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  32.22 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.97 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.56 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.6 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.6 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 483 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.39 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.68 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  33.95 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  33.94 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  32.34 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.81 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.34 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.3 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.3 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.3 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.3 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  38.02 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>