More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2398 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  100 
 
 
415 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  59.76 
 
 
409 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  58.87 
 
 
412 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  55.61 
 
 
407 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  52.46 
 
 
449 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  51.97 
 
 
424 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  50 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  46.34 
 
 
469 aa  336  5.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  49.62 
 
 
413 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  47.94 
 
 
428 aa  328  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  48.94 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  45.67 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  44.42 
 
 
475 aa  302  9e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  41.09 
 
 
462 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  42.68 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  45.41 
 
 
425 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  38.62 
 
 
435 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.04 
 
 
451 aa  236  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.49 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.18 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.18 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.74 
 
 
464 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.74 
 
 
464 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.9 
 
 
464 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.9 
 
 
464 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.99 
 
 
464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  37.93 
 
 
487 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.92 
 
 
464 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.74 
 
 
464 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  33.5 
 
 
464 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  39.3 
 
 
482 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.25 
 
 
481 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  38.94 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  46.21 
 
 
403 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  46.08 
 
 
484 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.79 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.93 
 
 
445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  39.47 
 
 
403 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.63 
 
 
554 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  32.68 
 
 
461 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.88 
 
 
477 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.88 
 
 
476 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.88 
 
 
476 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  41.46 
 
 
401 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.54 
 
 
486 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  35.73 
 
 
402 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  44.62 
 
 
395 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.92 
 
 
484 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  35.37 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  37.77 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  38.35 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  42.75 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  37.83 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  38.64 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.27 
 
 
455 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  37.76 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.55 
 
 
484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  47.55 
 
 
492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  40.75 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  47.43 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  42.38 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  45.96 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  40.96 
 
 
473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  40.91 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  37.13 
 
 
398 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  42.38 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  42.38 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  42.38 
 
 
399 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  42.01 
 
 
399 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.48 
 
 
483 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.88 
 
 
452 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  46.79 
 
 
481 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  44.49 
 
 
377 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.38 
 
 
498 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  35.53 
 
 
395 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.11 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  40.48 
 
 
406 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  43.85 
 
 
376 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  42.31 
 
 
467 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  35.1 
 
 
495 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.98 
 
 
476 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  39.54 
 
 
391 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  39.54 
 
 
391 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  49.6 
 
 
393 aa  186  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  39.54 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  39.54 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  39.54 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  34.75 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  39.54 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  39.54 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  39.54 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  34.75 
 
 
391 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  40.61 
 
 
395 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  39.34 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.46 
 
 
471 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  44.35 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  46.15 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  40.73 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  40.73 
 
 
391 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>