More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  100 
 
 		 475 aa  928    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  61.09 
 
 		 469 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  64.46 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  62.21 
 
 		 441 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  55.6 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  53.43 
 
 		 433 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  50.88 
 
 		 409 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  47.15 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  50.77 
 
 		 412 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  49.32 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  47.66 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  48.12 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  43.47 
 
 		 462 aa  322  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  46.87 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  40.58 
 
 		 487 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  44.7 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  43.69 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  38.36 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.29 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.35 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.35 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.12 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.12 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.12 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.75 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.75 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.12 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.95 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.52 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  40 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  29.81 
 
 		 464 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  38.67 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  33.86 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  33.85 
 
 		 482 aa  180  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40.48 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  33.55 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.56 
 
 		 481 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  34.23 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.33 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.57 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.57 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  38.26 
 
 		 390 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  31.31 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  35.53 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.49 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  36.14 
 
 		 399 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  31.39 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.09 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  35.5 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  40.93 
 
 		 394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  33.72 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  31.22 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.56 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  35.91 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  38.39 
 
 		 484 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.18 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.18 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.18 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  34.01 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  33.1 
 
 		 485 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.99 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  32.44 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.47 
 
 		 476 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.88 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  40.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  36.75 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  31.94 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  28.09 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  29.32 
 
 		 456 aa  154  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  32.75 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  36.72 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  39.46 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  25.12 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  27.53 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  27.53 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  30.39 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  37.33 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  32.4 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  32.4 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  38 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  38 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  38 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  30.39 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  33.55 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  33.99 
 
 		 372 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  37.1 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  31.83 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  40.62 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  36.79 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  35.29 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  34.93 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>