More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13241 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  100 
 
 
372 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  63.81 
 
 
365 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  63.81 
 
 
365 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  63.26 
 
 
365 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  62.71 
 
 
365 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  62.15 
 
 
365 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  46.39 
 
 
376 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  47.92 
 
 
368 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  42.15 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  45.51 
 
 
403 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  41.21 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  41.94 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  38.77 
 
 
399 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  38.77 
 
 
399 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  38.5 
 
 
399 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  40.06 
 
 
398 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  38.5 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  38.77 
 
 
399 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  37.23 
 
 
399 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  37.77 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  38.7 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  43.39 
 
 
393 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  37.7 
 
 
399 aa  232  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  45.81 
 
 
390 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  37.43 
 
 
399 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  36.83 
 
 
391 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  37.77 
 
 
399 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  44.64 
 
 
401 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  36.29 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  40.43 
 
 
395 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  39.34 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  39.39 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  46.25 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  39.12 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  39.12 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  37.54 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.82 
 
 
391 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  39.39 
 
 
391 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  39.39 
 
 
391 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  39.39 
 
 
391 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  39.39 
 
 
391 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  39.39 
 
 
391 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  40.32 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.69 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  37.69 
 
 
391 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  37.69 
 
 
391 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  37.4 
 
 
391 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  41.69 
 
 
407 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  37.15 
 
 
391 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  45.94 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  38.15 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  35.25 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  38.76 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  38.76 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  38.04 
 
 
484 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  39.05 
 
 
421 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  41.94 
 
 
409 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  43.24 
 
 
397 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  40.12 
 
 
449 aa  189  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  38.19 
 
 
415 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  40.41 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  45.85 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  49.81 
 
 
503 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  42.41 
 
 
554 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  43.7 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  39.05 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  42.31 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  44.75 
 
 
455 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  43.56 
 
 
465 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  43.97 
 
 
482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  44.53 
 
 
486 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  44.36 
 
 
495 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  41.8 
 
 
428 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  44.14 
 
 
425 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  40.59 
 
 
483 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  39.77 
 
 
435 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.91 
 
 
460 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  41.25 
 
 
469 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  42.75 
 
 
445 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  42.08 
 
 
447 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  45.32 
 
 
476 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.69 
 
 
464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  38.89 
 
 
441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.02 
 
 
476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  31.78 
 
 
469 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  40.78 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  33.58 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.36 
 
 
481 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  36.33 
 
 
467 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  39.84 
 
 
452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.85 
 
 
464 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.21 
 
 
464 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.21 
 
 
464 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  33.68 
 
 
498 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.21 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.21 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.21 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.85 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.85 
 
 
464 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.85 
 
 
464 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>