More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3683 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  100 
 
 		 368 aa  713    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  47.65 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  47.55 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  46.9 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  44.81 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  45.43 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  45.43 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  44.16 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  43.98 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  42.86 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  41.69 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  41.07 
 
 		 399 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  36.19 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  39.23 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  40.62 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  40.31 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  39.53 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  39.53 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  37.77 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  45.43 
 
 		 377 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  44 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  39.23 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  44.48 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  36.7 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  38.94 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  38.94 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  42.9 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  39.65 
 
 		 403 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  42.51 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  35.2 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  37.01 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  35.2 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  45.48 
 
 		 484 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  42.05 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  41.6 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  32.52 
 
 		 395 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  43.56 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  36.84 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  33.83 
 
 		 402 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  36.15 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  36.41 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  36.15 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  36.15 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  36.15 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  42.07 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  32.25 
 
 		 391 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  44.36 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  42.24 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  36.11 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  36.11 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  36.73 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  36.11 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  36.42 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  36.42 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  36.42 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  36.42 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  35.24 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  43.06 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  35.69 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 409 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  44.7 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  42.42 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  45.21 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  43.42 
 
 		 481 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  44.19 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  41.95 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  43.35 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  40.13 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  39.62 
 
 		 451 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  41.18 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  41.5 
 
 		 482 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  40.39 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 485 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  40.23 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  42.01 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  41.54 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  43.35 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.96 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.96 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  39.55 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  44.96 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.47 
 
 		 483 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.99 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  42.06 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  38.98 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  43.02 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  35.64 
 
 		 461 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.06 
 
 		 467 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  34.53 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  37.26 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.64 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  34.6 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  36.95 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  34.98 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  33.45 
 
 		 452 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.25 
 
 		 492 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.77 
 
 		 476 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  39.93 
 
 		 466 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>