More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3421 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  100 
 
 		 402 aa  828    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  57.26 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  55.38 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  55.64 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  55.64 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  55.64 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  55.64 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  55.64 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  55.38 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  55.64 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  55.38 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  55.41 
 
 		 391 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  55.15 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  55.15 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  55.61 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  55.01 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  55.01 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  54.84 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  50.53 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  49.21 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  46.6 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  46.6 
 
 		 391 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  42.42 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  40.47 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.55 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  39.64 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  40.47 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  38.87 
 
 		 399 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  38.97 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  39.09 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  38.82 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  38.82 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  39.09 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  38.56 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  38.64 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  38.46 
 
 		 399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  38.52 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  40.91 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  42.9 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  44.34 
 
 		 484 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40.21 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  38.46 
 
 		 421 aa  245  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  39.73 
 
 		 403 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  39.37 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  37.97 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  39.53 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  40.76 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  39.88 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  39.88 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  39.18 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  40.19 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  42.2 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  37.54 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  37.85 
 
 		 377 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  37.32 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  35.73 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  37.86 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  37.14 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  36.88 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.39 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  41.61 
 
 		 425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  35.89 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.64 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  42.28 
 
 		 503 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.44 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.4 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  34.57 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.4 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  41.15 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.4 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  36.17 
 
 		 407 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.4 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.94 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.94 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.94 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.96 
 
 		 492 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.96 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  33.83 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.96 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  36.67 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 464 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  37.55 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.41 
 
 		 481 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  36.06 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  38.08 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  35.52 
 
 		 498 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  35.87 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.93 
 
 		 482 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  37.12 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.24 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.69 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.58 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.96 
 
 		 481 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  38.28 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.33 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.33 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  36.15 
 
 		 486 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.57 
 
 		 554 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  34.81 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>