More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4032 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  100 
 
 		 376 aa  744    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  46.93 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  48.18 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  48.18 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  47.9 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  45.96 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  46.39 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  44.16 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  45.05 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  41.37 
 
 		 398 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  39.95 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  37.1 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  41.49 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  39.02 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  39.02 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  37.01 
 
 		 403 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  38.69 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  38.31 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  38.69 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  45.12 
 
 		 484 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  38.03 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  38.39 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  46.3 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  38.39 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  38.39 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  47.86 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  36.97 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  42.39 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  38.39 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.84 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  42.74 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  37.46 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  43.49 
 
 		 401 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  40.19 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  37.66 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  40.31 
 
 		 391 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  40.49 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  36.1 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  38.81 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  39.69 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  38.81 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  38.81 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  48.83 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  39.38 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  42.91 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  39.06 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  35.55 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  38.75 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  43.85 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  38.37 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  42.86 
 
 		 483 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  38.97 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  42.8 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  42.47 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  45.63 
 
 		 482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  44.36 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.31 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  44.06 
 
 		 424 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  41.67 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  42.91 
 
 		 503 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  39.03 
 
 		 485 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  41.95 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  39.69 
 
 		 447 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  43.77 
 
 		 465 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  35.23 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  42.69 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  41.15 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  41.04 
 
 		 469 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.69 
 
 		 461 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.3 
 
 		 451 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  40.12 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  36.84 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  42.05 
 
 		 495 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  36.51 
 
 		 464 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.3 
 
 		 464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  38.64 
 
 		 435 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  34.07 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  39.16 
 
 		 486 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  39.77 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  39.11 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  38.06 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  33.08 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  33.08 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  35.5 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.94 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>