More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  100 
 
 		 435 aa  853    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  41.16 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  38.62 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  40.14 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  38.3 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  40.36 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  40.48 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  41.91 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  39.76 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  36.3 
 
 		 462 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  39.95 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  39.51 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  34.9 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  38.16 
 
 		 407 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  40.56 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  36.03 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  36.02 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  34.84 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  36.62 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.52 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.89 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  42.55 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  42.01 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  37.73 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  38.99 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  33.09 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  33.7 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  31.83 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  31.14 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.6 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.41 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  27.95 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  39.16 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.17 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  29.41 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  38.64 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  37.59 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  39.77 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  36.23 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  38.41 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.75 
 
 		 554 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  36.02 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  37.01 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  36.75 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  35.49 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  34.94 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.61 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.61 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.61 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.12 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  37.59 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0376  anthranilate synthase component I  36.82 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957074  normal  0.0417216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  35.25 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.8 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  35.4 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.61 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  28.78 
 
 		 506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  32.82 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.54 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.35 
 
 		 464 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  35.25 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.35 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  36.86 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.35 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  37 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  37.83 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  36.13 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  36.13 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  36.13 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  31.75 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.35 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  32.01 
 
 		 491 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4195  anthranilate synthase component I  35.36 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.79 
 
 		 481 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  36.68 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28130  anthranilate synthase component I  35.34 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.85 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  34.4 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  34.89 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  35.21 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  35.21 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  35.4 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  34.36 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  35.21 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.17 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  35.21 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  37.09 
 
 		 539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  37.2 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1992  anthranilate synthase component I  35.62 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.221966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  35.21 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2771  anthranilate synthase component I  35.42 
 
 		 511 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00110459  hitchhiker  0.00000354378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  32.97 
 
 		 472 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  32.59 
 
 		 492 aa  132  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1071  anthranilate synthase, component I  39.72 
 
 		 485 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.14675  normal  0.387124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  34.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  34.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  34.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4052  anthranilate synthase, component I  34.98 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  34.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>