More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1234 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  100 
 
 
465 aa  951    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  28.23 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.64 
 
 
464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.78 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  30.28 
 
 
451 aa  183  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  30.14 
 
 
455 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  37.08 
 
 
486 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  30.56 
 
 
467 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.04 
 
 
482 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.75 
 
 
464 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.75 
 
 
464 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.39 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.39 
 
 
464 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40.46 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.39 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.39 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.44 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.11 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.05 
 
 
464 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  30.28 
 
 
464 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.85 
 
 
481 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.23 
 
 
477 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  29.93 
 
 
407 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.85 
 
 
476 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.85 
 
 
476 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  34.85 
 
 
415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  37.02 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  29.03 
 
 
452 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.74 
 
 
476 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.53 
 
 
451 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.31 
 
 
484 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  27.23 
 
 
495 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.32 
 
 
476 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.59 
 
 
445 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  35.85 
 
 
465 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.31 
 
 
484 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  36.3 
 
 
485 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.31 
 
 
492 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.69 
 
 
481 aa  157  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  35.96 
 
 
449 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  33.72 
 
 
412 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  29.9 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.9 
 
 
471 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  29.95 
 
 
506 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  31.83 
 
 
435 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  29.27 
 
 
492 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.32 
 
 
379 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  29 
 
 
492 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  29.43 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  34.56 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  32.27 
 
 
403 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  35.42 
 
 
462 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  27.66 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  35.11 
 
 
483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  35.29 
 
 
447 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  31.55 
 
 
451 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  28.93 
 
 
428 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  29.4 
 
 
456 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  30.97 
 
 
554 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  34.39 
 
 
391 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  34.78 
 
 
487 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  34.39 
 
 
391 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  34.39 
 
 
391 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  34.39 
 
 
391 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  34.39 
 
 
391 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  34.39 
 
 
391 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  34.39 
 
 
391 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  34.39 
 
 
391 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  34.39 
 
 
391 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  28.57 
 
 
453 aa  143  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  28.57 
 
 
453 aa  143  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  35.23 
 
 
424 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  35.29 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  34.98 
 
 
377 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  34.39 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  34.39 
 
 
391 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  34.39 
 
 
391 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  34.39 
 
 
391 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  34.13 
 
 
498 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  34.39 
 
 
391 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  32.41 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  27.71 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  33.96 
 
 
413 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  30.29 
 
 
469 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3213  anthranilate synthase component I  28.47 
 
 
488 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0493446  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  34.05 
 
 
391 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  34.05 
 
 
391 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  32.1 
 
 
442 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  32.63 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  33.04 
 
 
433 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  32.93 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2227  anthranilate synthase component I  35.38 
 
 
520 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  33.74 
 
 
395 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  33.33 
 
 
398 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2132  anthranilate synthase component I  27.99 
 
 
500 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  28.75 
 
 
495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  33.46 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  33.59 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.03 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>