More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0774 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  100 
 
 		 379 aa  773    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  42.64 
 
 		 386 aa  325  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  32.58 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  37.84 
 
 		 467 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  33.81 
 
 		 464 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  30.34 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  31.26 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  35.74 
 
 		 482 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  36.82 
 
 		 469 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.67 
 
 		 464 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.79 
 
 		 460 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.82 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.82 
 
 		 464 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.39 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.82 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.53 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.53 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.13 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.53 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.53 
 
 		 464 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  36.63 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  27.62 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.74 
 
 		 481 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.88 
 
 		 476 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  33.96 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  32.18 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.11 
 
 		 476 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.61 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  31.32 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.62 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.14 
 
 		 476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  38.68 
 
 		 498 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.14 
 
 		 476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  32.95 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.14 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  33.98 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  33.7 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.95 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.05 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  35.27 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  35.27 
 
 		 492 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  31.11 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  30.38 
 
 		 451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  35.12 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  28.88 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  33.06 
 
 		 394 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  28.88 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  30.97 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  28.73 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  31.84 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  34.85 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  30.15 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.26 
 
 		 471 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  32.31 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  30.95 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  30.55 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  37.13 
 
 		 471 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  26.71 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  29.77 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  34 
 
 		 444 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  33.45 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  33.45 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  30.14 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  29.31 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  33.05 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  29.62 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  29.13 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  33.05 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  26.53 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  32.75 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  28.37 
 
 		 407 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  31.08 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  33.1 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  32.22 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  32.16 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  31.56 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  31.27 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  27.27 
 
 		 554 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  30.92 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  30.92 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.58 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  33.21 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.65 
 
 		 473 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  32.94 
 
 		 473 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.83 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  33.99 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>