More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3204 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  100 
 
 		 442 aa  907    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  93.21 
 
 		 442 aa  811    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  66.74 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  65.9 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  55.48 
 
 		 455 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  55.26 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  55.03 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  55.99 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  53.94 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.94 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  53.94 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  53.94 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  54.17 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.94 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  54.17 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.44 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.56 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.56 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  54.17 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.56 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  53.56 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  54.17 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  50.7 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  45.67 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  45.56 
 
 		 435 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  42.39 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  42.36 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  38.04 
 
 		 427 aa  259  9e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  39.43 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  38.82 
 
 		 452 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  38.82 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  38.15 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  36.89 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  37.77 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  37.32 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  37.32 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  37.56 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  36.34 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  36.87 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  37.26 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  36.71 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  38.3 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  33.63 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  35.28 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.9 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  30.86 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.84 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  31.16 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  32.77 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32.85 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.51 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  31.48 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  35.1 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  35.93 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.72 
 
 		 506 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  33.74 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  31.99 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  36.5 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.63 
 
 		 486 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.08 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.08 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  36.64 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  34.91 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.13 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.14 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  37.74 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.7 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  35.32 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  32.41 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.31 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.49 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  34.9 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  32.1 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.83 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.2 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.2 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  28.45 
 
 		 359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  32.58 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  32.75 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.9 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.45 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  35.27 
 
 		 483 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  36.51 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  30.48 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  32.31 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  32.31 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  32.97 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  32.49 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  33.7 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  35.27 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.12 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  32.25 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  34.69 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  33.08 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  34.07 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  32.31 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  32.73 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.31 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.55 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>